AlphaFold 3
DeepMind навчила систему передбачати структуру не окремого білка, а комплексу: білок із ДНК, з ліками, з іонами — усе в одній моделі.
Чому це важливо
Передбачення перейшло від форми однієї молекули до того, як молекули тримаються одна за одну, а це і є хімія життя.
AlphaFold 2 давала форму білка. Але клітина працює взаємодіями: білок зчіплюється з ДНК, з малою молекулою, з іншим білком. AlphaFold 3 замінила спеціалізований геометричний модуль на дифузійний, який породжує координати атомів напряму, і це дало змогу описати всі типи молекул однаково. Для взаємодій білка з ліками точність перевищила спеціалізовані методи докінгу. Модель випустили не у відкритий доступ, а через вебсервер з обмеженнями, і це викликало окрему суперечку про відтворюваність.